Curso: Vigilancia Genómica de Arbovirus. Módulo I

28 y 29 de octubre 2024

Cierre de inscripciones gratuitas el domingo 20 de octubre

INTRODUCCIÓN

Diversos factores han contribuido al reciente resurgimiento y propagación de enfermedades transmitidas por mosquitos, como el Dengue, Zika y Chikungunya. Dentro de estos factores están una mala la urbanización, el cambio climático, el limitado control de mosquitos, la pobreza, y el deterioro de la salud pública. Estos factores, y la carencia de una vacuna que nos proteja eficazmente de estas infecciones, así como y la falta de tratamientos efectivos las convierten en un gran reto para los sistemas de Salud Pública.

En la última década la secuenciación del genoma completo o fragmentos del material genético de diferentes patógenos ha tenido un papel crucial en la detección y manejo de brotes, epidemias y pandemias de enfermedades infecciosas. Esta tecnología ha sido fundamental para respaldar el desarrollo de métodos diagnósticos, medicamentos y vacunas. Al mismo tiempo ha generado información relevante para entender la evolución de las epidemias y pandemias

A pesar de la gran importancia de las enfermedades causadas por arbovirus (Dengue, Zika y Chikungunya), no existen programas de vigilancia genómica para seguir su evolución. Sin embargo, la comprensión de cómo la información sobre la secuencia del genoma de un virus puede contribuir a mejorar la salud pública está estimulando la generación de programas de vigilancia genómica en diferentes países. Así mismo, la disminución en el costo y en la complejidad de generar secuencias genómicas permite la expansión de las capacidades de secuenciación.

Para el funcionamiento de un laboratorio de análisis genómico se identifica que es necesario contar con tres elementos: equipamiento tecnológico, formación de investigadores en materia de bioinformática, y la implementación de una red de colaboración que incluya al sistema de salud. Para lograr lo anterior el Instituto de Innovación Ciencia y Emprendimiento para la Competitividad del Estado de Guanajuato y Cinvestav, con el apoyo de otras instituciones y organizaciones como la UNAM y la Univerisdad Autónoma de la Ciudad de México y CABANAnet, han acordado capacitar a profesionistas altamente especializados en el uso de herramientas bioinformáticas para la vigilancia genómica de arbovirus.

Por todo lo anterior, hemos planeado un curso que consta de dos modulos, uno teórico y uno que incluye la parte practica. Este es el primero de los dos modulos que ofreceremos sobre vigilancia genómica de arbovirus y es esencial para poder participar en el segundo modulo.

OBJETIVOS

• Proporcionar los conceptos básicos de la biología de Dengue y Zika
• Proporcionar los conceptos básicos para el manejo y análisis de datos genómicos de arbovirus para la vigilancia epidemiológica.
• Proporcionar las bases teóricas para el diseño experimental en estas áreas.
• Proporcionar las bases fundamentales para interpretar resultados del análisis de datos.

CONTENIDO GENERAL DEL CURSO:

Día 1

9:00-11:00 hrs. Introducción a la Biología de Dengue y Zika (Dra. Rosa María del Angel Nuñez, Cinvestav).

11:00-12:00 hrs. Breve introducción a la genómica y técnicas de secuenciación masiva.  (Dr. Alfredo Herrera Estrella, Cinvestav).

1. 1. ¿Qué es y para que nos sirve la secuencia del genoma de un organismo?
   2. Tecnologías actuales de secuenciación masiva.

12:00-12:15 hrs. Receso

12:15-14:15 hrs. Diversidad de los viromas de mosquitos (Dr. Miguel García Knight, IIB UNAM).

Día 2

9:00-11:00 hrs. Evolución de Dengue y Zika (Dra. Selene Zárate, UACM).

1. 1. Conceptos básicos de evolución y genética de poblaciones
   2. Evolución de arbovirus

11:00-11:15 hrs. Receso

11:15-13:15 hrs. Secuenciación y análisis de genomas de Dengue y Zika (Dr. Alejandro Sánchez, IBT UNAM).

1. 3. Herramientas para el control de calidad, filtrado y limpieza de datos de secuenciación.
   4. Herramientas disponibles para el alineamiento y ensamblado de genomas virales.

PERFIL DEL PÚBLICO ASISTENTE:

Este curso internacional está dirigido al público en general con conocimientos en clínica, biología, computación y/o afines, con interés en biología molecular, genómica y bioinformática.

Se extenderá constancia de participación a los asistentes que concluyan el proceso de inscripción y asistan, como mínimo, al 80% de las clases.

Las inscripciones estarán abiertas hasta el domingo 20 de octubre.

DISEÑO Y METODOLOGÍA DEL CURSO.

El curso se llevará a cabo de manera virtual usando la plataforma TEAMs.  Las sesiones serán grabadas y permanecerán disponibles hasta 1 mes después del evento.

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