DR. CARLOS HUMBERTO ORTIZ RAMÍREZ
Laboratorio Genética y Genómica del Desarrollo
Investigador 2B, SNI I
4621663000 ext. 3072
carlos.ortiz@cinvestav.mx
Líneas de investigación
• Transcriptómica de alta resolución (célula única) para identificar redes genéticas tejidoespecíficas responsables del desarrollo de patrones celulares y morfogénesis en organismos multicelulares.
• Identificación de las bases moleculares que determinan la eficiencia fotosintética mediante mapeo de QTLs y GWAS en poblaciones de maíz ancestrales con alta diversidad genética.
• Transferencia de caracteres C4 a plantas C3 mediante técnicas de edición genética (CRISPR) para incrementar la fijación de carbono y aumentar la productividad en el contexto del cambio climático.
- Transcriptómica comparativa a nivel de célula única (secuenciación de célula única) de especies con fotosíntesis C3 y C4.
- Identificación de las bases genéticas que controlan la eficiencia fotosintética en poblaciones de maíz nativo mediante mapeo por QTLs y GWAS.
- Factores de transcripción implicados en la emergencia de diversidad morfológica y la evolución de tipos celulares nuevos.
- Desarrollo de un mapa celular inmune de poblaciones latinoamericanas. (Iniciativa Chang-Zuckerberg).
- Patrones de expresión alelo especifcos en lupuseritematososistémicodurante la inducción de tolerancia
Semblanza
Nuestro grupo busca entender cómo las células de las plantas adquieren su identidad y cuáles son las señales que controlan la emergencia de tipos celulares en tiempos y lugares específicos para formar órganos. En particular, trabajamos en identificar los genes que controlan el desarrollo de las hojas que realizan fotosíntesis C4. En estas especies la modificación en el patrón de desarrollo de unos pocos tipos de células da lugar a un incremento sustancial de la eficiencia fotosintética (hasta 50 por ciento). Utilizamos al maíz, milo y trigo como sistemas biológicos, así como técnicas de edición génica (CRISPR) y genómica de alta resolución (secuenciación de célula única), con el objetivo a largo plazo de transferir características C4 a cereales C3 de interés comercial, mejorando así su productividad e incrementando su tolerancia al estrés hídrico y al calor.
- C. Ortiz-Ramirez et al., Ground tissue circuitry regulates organ complexity in maize and Setaria. Science 374, 1247-1252 (2021).
- C. Ortiz-Ramirez, E. D. Arevalo, X. Xu, D. P. Jackson, K. D. Birnbaum, An Efficient Cell Sorting Protocol forMaize Protoplasts. Current Protocols in Plant Biology 3, e20072 (2018).
- C. Ortiz-Ramirez et al., GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE channels are essential for chemotaxis and reproduction in mosses. Nature 549, 91-95 (2017).
- C. Ortiz-Ramírez et al., A Transcriptome Atlas of Physcomitrella patens Provides Insights into the Evolution and Development of Land Plants. Molecular plant 9, 205-220 (2016).
- M. Hernandez-Coronado, C. Ortiz-Ramirez, Root Patterning: Tuning SHORT ROOT Function Creates Diversity in Form. Frontiers in plant science 12, 745861 (2021).
- C Ortiz-Ramirez, SI Mora, J Trejo, O Pantoja. 2011. PvAMT1; 1, a highly selective ammonium transporter that functions as H+/NH4+ symporter. Journal of Biological Chemistry 286 (36), 31113-31122 (2011)