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Laboratorio de Metabolómica y Espectrometría de Masas

Metabolomic's Lab

El Laboratorio de Metabolómica y Espectrometría de Masas comenzó operaciones al público en enero de 2015. Se encuentra ubicado en el segundo piso del edificio A de laboratorios de la institución. La investigación que se desarrolla es financiada a través de proyectos Conahcyt. Con el fin de atraer fondos continuamente se está participando en las diferentes convocatorias de instituciones gubernamentales y no gubernamentales. Además de ello, el laboratorio está enfocado en el servicio interno y externo tanto a academia como a empresas y particulares, ofreciendo diferentes técnicas de análisis, mediante el manejo de diversas plataformas de cromatografía y espectrometría de masas. Somos un laboratorio especializado que colabora y apoya a colegas a través de un espectro de disciplinas, al mismo tiempo que desarrollamos proyectos de nuestros propios intereses de investigación. Proporcionamos acceso a una amplia gama de técnicas de cromatografía y espectrometría de masas que mejoran proyectos de investigación. Nuestra experiencia en el campo de la cromatografía y espectrometría de masas está disponible para clientes corporativos e instituciones académicas externas. A través de nuestro personal altamente capacitado, colaboramos estrechamente con nuestros clientes para atender sus requerimientos. Esto implica realizar análisis de muestras, establecer contratos de investigación, ofrecer cursos de capacitación y brindar servicios de consultoría. Si desconoce cuál es la mejor opción para su proyecto de investigación y quisiera discutir sus ideas, póngase en contacto con nosotros para diseñar la mejor estrategia analítica que le brinde los mejores resultados para su proyecto.

 


Misión

Impulsar el uso de las diferentes técnicas de cromatografía y espectrometría de masas para el análisis cualitativo y cuantitativo, que permitan facilitar la investigación científica en proyectos académicos y del área industrial, en la región, a nivel nacional e internacional. Además, de establecer convenios de colaboración con instituciones académicas y empresariales.

Visión

Ofrecer soluciones especialmente diseñadas para las diferentes demandas de análisis de identificación y cuantificación a través del uso de la cromatografía y espectrometría de masas. Además, de la continua formación de recursos humanos capacitados en el área, y de la difusión del uso y el potencial de las distintas técnicas.

Ofrecemos una amplia gama de opciones:

  • Metabolómica
  • Lipidómica
  • Proteómica
  • Glicómica

Estamos abiertos al desarrollo de nuevas técnicas para cubrir necesidades específicas de nuestros clientes.

  • Identificación y cuantificación de azúcares simples: sacarosa, glucosa, fructosa, xilosa, lactosa, oligosacáridos.
  • Identificación y cuantificación de lípidos.
  • Identificación y cuantificación de fructo-oligosacáridos.
  • Identificación y cuantificación de compuestos fenólicos, flavonoides, flavonoles, ácidos orgánicos, ácidos hidroxicinámicos.
  • Identificación y cuantificación de aditivos alimenticios, conservadores y edulcorantes.
  • Identificación y cuantificación de carotenoides.
  • Identificación y cuantificación de aflatoxinas (previamente purificadas por cromatografía de afinidad).
  • Identificación y cuantificación de ácidos orgánicos.
  • Identificación y cuantificación de metabolitos primarios (aminoácidos, lípidos, ácidos grasos).
  • Cuantificación de plaguicidas varios.
  • Identificación de compuestos bioactivos.
  • Identificación de gases.

En esta plataforma se ofrecen técnicas de análisis elemental en las siguientes matrices:

  • Análisis de agua
  • Análisis de suelo
  • Análisis de granos maíz
  • Análisis de pulpa de aguacate
  • Análisis de bebidas energéticas
  • Análisis de grano de café
  • Análisis de pasta de tomate
  • Análisis de leche
  • Análisis de soya
  • Análisis de espinacas

Si se requiere también se pone a disposición la extracción y/o digestión de la muestra previo al análisis por ICP-MS.

  • Medición de masa exacta, perfiles metabólicos.
  • Metabolómica no dirigida en muestras extraídas de diferentes matrices líquidas o sólidas y provenientes de tejido animal o vegetal.
  • Detección y cuantificación de metabolitos provenientes de matrices varias, alimentos, plantas y/o animales.
  • Identificación de proteínas en bandas de gel
  • Secuenciación de novo de péptidos no ribosomales (NRP)
    • Péptidos cíclicos
    • Péptidos lineales
  • Identificación de proteínas shotgun por nanoLC-MS/MS (nanoAcquity – Synapt G1)
  • Cuantificación de proteínas sin marcado por nanoLC-MSE (nanoAcquity – Synapt G1)
  • Desarrollos bajo demanda:
    • Métodos de cuantificación de proteínas con marcado (SILAC, etc.)
    • Interactómica: identificación de complejos proteicos
    • Etc.
  • Medición de masa exacta, perfiles metabólicos, información estructural por fragmentación (MS2 y MS3).
  • Metabolómica dirigida y no dirigida en muestras extraídas de diferentes matrices líquidas o sólidas y provenientes de tejido animal o vegetal.
  • Identificación y cuantificación de metabolitos y proteínas.
  • Medición de sección transversal colisional promedio CCS (Ω en Å2). Figura 1.
  • MS Scan, fragmentación MSMS, fragmentación dirigida MSMS, fragmentación dirigida y no dirigida antes o después de separación por movilidad iónica.
  • Pre-identificación de metabolitos de interés usando Progenesis QI y bases de datos en linea.
  • Generación de posibles metabolitos (pre-identificados o no) por Progenesis QI compatible con Excel.
  • MALDI imaging.

 

  • GC-MS-EI System (Agilent Technologies, USA)
  • HPLCs 1200 Series con FLD, DAD y ELSD (Agilent Technologies, USA)
  • ICP- MS System (Perkin Elmer/Sciex USA)
  • LCT Premier XE TOF (Waters, UK)
  • SYNAPT MALDI HDMS QTOF (Waters, UK)
  • Dr. José Juan Ordaz Ortiz

Investigador titular

jose.ordaz.ortiz@cinvestav.mx

metabolomics@cinvestav.mx

Tel: +52 (462) 166 3025


 

 

 


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