Maribel Hernández Rosales
Laboratorio de Bioinformática y Redes Complejas
Investigadora Cinvestav 3A
SNII I
(462) 623 96 00 Ext. 9688
maribel.hr@cinvestav.mx
Líneas de investigación
- Algoritmos para la reconstrucción de historias evolutivas de familias de genes.
- Machine learning y deep learning para la clasificación taxonómica en metagenomas, entre otros problemas biológicos.
- Construcción y análisis de redes para el estudio de interacciones microbianas, planta-patógeno, co-expresión y corregulación de genes.
- Estudio del comportamiento humano a partir de datos de geolocalización.
Proyectos relevantes
- Conacyt Alemania-México “Improved Orthology Assignments for Functional and Evolutionary Genomics”.
- ConacytCiencia Básica “DNA-mutation simulation of tumor growth and reconstruction of cancer evolution”.
- Fondo Conjunto México-Uruguay AMEXID “Redes de movilidad para el estudio de comportamiento humano”.
- Conacyt Pronaces “Producción de biocombustibles para uso rural a partir de desechos agropecuarios mediante la optimización de consorcios microbianos usando metagenómica”.
- Universidad de California – Cinvestav “Looking for clues to today's problem of antibiotic-resistant strains in ancient microbial mats”.
Semblanza
Licenciada en Ciencias de la Computación por la Facultad de Ciencias de la UNAM. Doctora en Ciencias por la Universidad de Leipzig, Alemania. Cátedra Conacyt en el Instituto de Matemáticas de la UNAM Juriquilla de 2014 a 2020. Secretaria de la Red Mexicana de Bioinformática de 2018 a 2022. Ha participado como mentora en el programa 1000 girls – 1000 futures del Global STEM Alliance y de la New York Academy of Science.
Publicaciones recientes y/o relevantes
- Aviña Padilla, K.; Zambada Moreno, O.; Herrera Oropeza, G.E.; Jimenez Limas, M.A.; Abrahamian, P.; Hammond, R.W.; Hernández Rosales (2022). M. Insights into the Transcriptional Reprogramming in Tomato Response to PSTVd Variants Using Network Approaches. Int. J. Mol. Sci., 23, 5983. DOI: 10.3390/ijms23115983.
- Aviña Padilla, K. et al. (2022). Deciphering the Tissue-Specific Regulatory Role of Intronless Genes Across Cancers. In: Jin, L., Durand, D. (eds) Comparative Genomics. RECOMB-CG 2022. Lecture Notes in Computer Science(), vol 13234. Springer, Cham. DOI: 10.1007/978-3-031-06220-9_18.
- Aviña Padilla K, Ramírez Rafael JA, Herrera Oropeza GE, Muley VY, Valdivia DI, Díaz Valenzuela E, García García A, Varela Echavarría A and Hernández Rosales M (2021). Evolutionary Perspective and Expression Analysis of Intronless Genes Highlight the Conservation of Their Regulatory Role. Front. Genet. 12:654256. DOI: 10.3389/fgene.2021.654256.
- Marcus Lechner, Maribel Hernandez Rosales, Daniel Doerr, Nicolas Wieseke, Annelyse Thevenin, Jens Stoye, Sonja J. Prohaska and Peter F. Stadler. (2014). Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Data Sets. PlosONE, 9(8):e105015. DOI: 10.1371/journal.pone.0105015.
- Hernandez Rosales, M., Hellmuth, M., Wieseke (2012). N. et al. From event-labeled gene trees to species trees. BMC Bioinformatics 13 (Suppl 19), S6. DOI: 10.1186/1471-2105-13-S19-S6.
Información Relevante
- Miembro del Board of Editors del Journal of the Royal Society Interface desde febrero del 2018.