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El Departamento de Farmacología fue establecido en 2001. Desde entonces, la labor del personal académico del departamento se ha manifestado en la generación de conocimientos científicos de alto nivel en las áreas básicas y clínicas de Farmacología y en la formación de recursos humanos de alta calidad.
Dicha labor ha merecido diversos reconocimientos, entre los que destacan en el 2002 Premio Nacional de la Juventud y en el 2020 el premio Pew Latin American Fellows.