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El Departamento de Farmacología fue establecido en 2001 con la finalidad de impactar de manera directa en el bienestar de la sociedad a través de su aplicación en disciplinas como la medicina, medicamentos genéricos y biocomparables, farmacovigilancia, nutrición, microbiota, obesidad, optogenética, transducción de señales, oncofarmacología, cáncer, estrés, problemas cardiovasculares y contaminación de mantos acuíferos, por nombrar algunos.