Luis Bernardo Flores Cotera

Biotecnología y Bioingeniería

Investigador Titular “Cinvestav 3B”, SNII II

Laboratorio 48 Metabolismo Secundario de Microorganismos

lfcotera@cinvestav.mx

5557473800 Ext. 4310

Semblanza:

Realizó estudios de Licenciatura en Ingeniería Química, y el Doctorado en Ciencias Bioquímicas, ambos, en la Facultad de Química de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). Estudió la maestría en ingeniería de procesos en Manhattan College, Nueva York, Estados Unidos. Ha sido profesor de Departamento de Biotecnología y Bioingeniería del Cinvestav durante más de 35 años, en donde fungió anteriormente como Coordinador Académico. Actualmente es Investigador y jefe del Departamento de Biotecnología y Bioingeniería del Cinvestav. Es coautor de más de 50 publicaciones, incluidas tres patentes estadounidenses, y 34 artículos publicados en revistas indizadas (ISI Web of Science, Core Collection), que han recibido más de 750 citas. Sus intereses de investigación incluyen el estudio de los mecanismos que les permiten a las células adaptarse a cambios ambientales y nutricionales. Así también, en su grupo de investigación se estudian los microorganismos asociados a plantas (endofítos) superiores nativas de México, en particular, el estudio de la actividad biológica (antitumoral, antidiabética, antibiótica, antiinflamatoria) de compuestos obtenidos de estos y otros microorganismos. Ha servido como revisor para más de 15 revistas científicas internacionales indizadas y brindado asesoramiento a diversas empresas, asociaciones e instituciones, especialmente en lo que respecta a la adquisición y evaluación de tecnología bioquímica. Actualmente es presidente de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería.

Líneas de investigación:

• Bioingeniería de fermentaciones, metabolismo secundario de microorganismos y respuesta adaptativa bajo estrés ambiental y nutricional (usando transcriptómica, metabolómica, proteómica).
• Estudio de compuestos bioactivos de interés farmacéutico derivados de microorganismos endofíticos de plantas originarias de México.

Proyectos relevantes:

• Estudio de la respuesta adaptativa de la levadura Phaffia rhodozyma en cultivos limitados por nutrientes específicos (Mg, P, N, Cu etc), en presencia de agentes tóxicos (antimicina, oligomicina etc.), o mutaciones específicas, mediante el uso de técnicas ómicas (Análisis transcriptómico, metabolómico …).
• Direccionamiento del flujo metabólico para la producción de astaxantina en Phaffia rhodozyma mediante los sistemas CRISPR-Cas9 y CRISPRi.
• Modificación genómica dirigida de citocromo c oxidasa de Phaffia rhodozyma mediante CRISPR-Cas9.
• Actividad antiproliferativa y proapoptótica de hongos endofíticos de Taxus globosa de la reserva de la biósfera de Sierra Gorda. Por ejemplo, aislamiento de metabolitos de Trichophaea sp, Graphostroma sp, Phoma sp. 
• Aislamiento, identificación y caracterización de compuestos producidos por microorganismos endófitos de Piper auritum, con capacidad para inhibir la glicación no enzimática de proteínas, in vitro.

Publicaciones recientes y/o relevantes:

• Ramos-Garza J, AV Rodríguez-Tovar, LB Flores-Cotera, FN Rivera-Orduña, S Vásquez-Murrieta, A Ponce-Mendoza, ET Wang (2016). Diversity of fungal endophytes from the medicinal plant Dendropanax arboreus in a protected area of Mexico. Ann Microbiol. 66:991–1002. https://doi.org/10.1007/s13213-015-1184-0.
• Bartolo-Aguilar Y, L Dendooven, C Chávez-Cabrera, LB Flores-Cotera, ME Hidalgo-Lara, L Villa-Tanaca, R Marsch (2017). Autolysis of Pichia pastoris induced by cold. AMB Express 7:95. https://doi.org/10.1186/s13568-017-0397-y.
• Gutiérrez-García K, A Neira González, RM Pérez Gutiérrez, G Granados-Ramírez, R Zarraga, K Wrobel, F Barona-Gómez, LB Flores-Cotera (2017). Phylogenomics of 2,4-diacetylphloroglucinol-producing Pseudomonas and novel antiglycation endohphytes from Piper auritum. J Nat Prod. 80(7):1955-1963. https://doi.org/10.1021/acs.jnatprod.6b00823.
• Martínez-Cárdenas A, C Chávez-Cabrera, JM Vásquez-Bahena, LB Flores-Cotera (2018). A common mechanism explains the induction of aerobic fermentation and adaptive antioxidant response in Phaffia rhodozyma. Microb. Cell. Fact. 17:53. https://doi.org/10.1186/s12934-018-0898-7.
• Flores-Cotera LB, C Chávez-Cabrera, A Martínez-Cárdenas, S Sánchez, OU García Flores (2021). Deciphering the mechanism by which the yeast Phaffia rhodozyma responds adaptively to environmental, nutritional and genetic cues. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 2021, 48, kuab048. https://doi.org/10.1093/jimb/kuab048. Articulo invitado para el número especial del JIMB: Arnold L. Demain: una vida vivida. Homenaje póstumo.
• Rochín-Hernández LS, Rochín-Hernández LJ, LB Flores-Cotera (2022). Endophytes, a potential source of bioactive compounds to curtail the formation and accumulation of advanced glycation end products: a review”. Molecules 27(14): Article number 4469. Special Issue "Microbial Natural Products: A Promising Source for Medical Application".  https://doi.org/10.3390/molecules27144469.
• Bartolo-Aguilar Y, Chávez-Cabrera C, Flores-Cotera LB, Badillo-Corona JA, Oliver-Salvador C, R Marsch (2022). The potential of cold-shock promoters for the expression of recombinant proteins in microbes and mammalian cells. J Genet Eng Biotechnol. 29;20(1):173. https://jgeb.springeropen.com/articles/10.1186/s43141-022-00455-9.
• Mora-Guzmán Z, LB Flores-Cotera, R López-Marure, D Soto-Castro, F Masso-Rojas, A Paéz, E Zenteno, E Pérez-Campos, R Martínez-Cruz, L Pérez-Campos Mayoral, MS Pina-Canseco (2024). Antiproliferative and pro-apoptotic activities of Tournefortia mutabilis vent. leaves on the human breast adenocarcinoma cell line (MCF-7). Iran J Pharm Res.  3(1): e149405. https://doi.org/10.5812/ijpr-149405.