La Biología Celular en México se inició en 1967 con la creación del Departamento de Genética y Biología Celular del Cinvestav. Los fundadores de este Departamento fueron Saúl Villa Treviño, representando al Departamento de Biología Celular, así como los doctores Manuel Ortega Ortega y Fernando Bastarrechea Avilés, relacionados con el Departamento de Genética. 

El proceso inicial de contratación de investigadores fue esencial para consolidar ambos departamentos, lo que condujo al establecimiento de líneas de investigación específicas y de esta manera, los Departamentos de Genética y Biología Celular adquirieron identidad propia. 

Finalmente, el Departamento de Biología Celular nació como una entidad independiente el 1 de febrero de 1973, siendo en su género, el más antiguo en América Latina. Su consolidación fue un proceso que abarcó el período de 1966 a 1979, y al final de éste, contaba con 10 investigadores activos, así como un programa de posgrado que ofrecía maestría y doctorado en el área.

En la actualidad, el Departamento de Biología Celular está constituido por 16 investigadores.