El Departamento de Biología Celular está ubicado en la sede Zacatenco del Cinvestav, con más de 56 años de historia. Actualmente está constituido por 16 investigadores que realizan actividades científicas relacionadas con tres vertientes:
A) Hacer investigación en diferentes aspectos de la estructura, fisiología e interrelaciones celulares en un organismo, principalmente Microbiología Molecular, Biología del Cáncer, Regulación de la expresión genética, Diferenciación Celular, Patología del Sistema Nervioso, Procesos de señalización, Citoesqueleto y Motilidad, entre otras.
B) Formación de investigadores de alto nivel con el grado de Doctor en Ciencias; o de profesores con el grado de Maestro en Ciencias con la capacidad de formar estudiantes avanzados a nivel de licenciatura.
C) Desarrollo de procesos biotecnológicos, vacunas y algunas otras tecnologías con impacto en la sociedad o en el sector productivo.